Még a szakértők körében is viták folynak arról, mi képezi az élő zátony-akvárium „legjobb” szűrőjét. Ennek ellenére a megfontolandó szűrők listája tartalmazhat élő kőzetet, fehérjeszűrőket és olajteknő szűrőket, amelyeket a legtöbb komoly hobbista elengedhetetlennek tart általában a tengeri akváriumok és különösen a zátonytartályok számára. Ez a három szűrőtípus biztosítja a kritikus szűrést.
Szűrés
Az akváriumokban háromféle szűrést kell biztosítania: mechanikus, kémiai és biológiai. A mechanikus szűrés abból áll, hogy a vízből törmelékeket fizikailag leszűrjük. A kémiai szűrés során a kémiai folyamatok a káros vegyi anyagok eltávolítását szolgálják az akvárium vizéből. A biológiai szűrés hosszú távú stabilitást biztosít és ösztönzi a hasznos baktériumok szaporodását. Ezek a baktériumok lebontják a halhulladékokat, mint az ammónia és a nitrit, és kevésbé toxikus nitrogénvegyületekké alakítják azokat.
Élő rock és élő homok
Az élő kőzetek és az élő homok biológiai szűrést biztosítanak. Az élő kőzetek régi, elhalt korallvázakból állnak, amelyeket más organizmusok telepítettek meg. Ide tartoznak a halhulladékot lebontó baktériumok. Az élő kőzetek és homok kedvező felület-térfogat arányú, ami a baktériumok fejlődését ösztönzi. Az élő kőzetek erőteljes biológiai szűrést biztosítanak, és a zátonytartály többi részének keretéül szolgálnak. A legtöbb korall és más ülő gerinctelenek élő kőzetre szerelhetők.
Protein Skimmers
A fehérjeborítók a fizikai és kémiai szűrés között húzódnak. A fehérjeskimmerek apró buborékokat hoznak létre, amelyek felfelé mozognak a fehérjeszimmer testén. A szerves vegyületek, például a szabadon úszó fehérjerészecskék tapadnak a buborékok felületi feszültségére, és finom habban gyűlnek össze a skimmer tetején. Az akváriumi hobbiban többféle típus létezik, köztük a régi stílusú légkőből készült skimmerek és a fejlettebb Venturi skimmerek. A légkőből készült skimmerek olcsóbbak és kevésbé hatékonyak. A Venturi skimmerek többe kerülnek, de kisebbek és csendesebbek. A költség és a hely általában meghatározza, hogy az emberek melyik skimmeret használják.
Szivattyúszűrők
Az öblítőszűrők egy második víztartályból állnak, gyakran egy újrahasznosított haltartályból. A legtöbb tengeri akvárium-hobbista barkácsolási utat választ, és elkészíti a sajátját, az ürítőt saját szükségleteihez igazítva. A kivitel sajátosságaitól függően az ürítőszűrő mind a három típusú szűrést képes biztosítani. Gyakran tartalmaznak olyan táptalajokat, amelyek célja a hasznos baktériumok - akár extra élő kőzetek - szaporodásának ösztönzése. A leöntőszűrők előnyösek, ha elrejtik az olyan berendezéseket, mint a fehérjeszkennerek az aknában, és nem látják az akvárium állványát.
